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蛋白质SDS-PAGE电泳的原理与技巧 SDS-PAGE电泳是一种广泛使用的蛋白质分离技术,其核心原理是利用SDS(十二烷基硫酸钠)与蛋白质结合,形成带负电荷的复合物,从而在电场中按照分子量大小进行分离。SDS-PAGE的缓冲体系主要有两种:Tris-Glycine和Tris-Acetate。 研ris-Glycine体系:这是一种经典的缓冲体系,特别适合10-300kDa的蛋白质分离。其优点是成本低、操作简单,非常适合手工灌胶。然而,该体系的碱性环境可能导致丙烯酰胺降解,因此保存期较短。 젔ris-Acetate体系:这种体系适用于大分子蛋白质的分离,通常用于250kDa以上的蛋白质。它的缓冲能力更强,适合需要分离大分子的实验。 堨🇧 𘩓APS):过硫酸铵在水溶液中水解生成硫酸氢铵和过氧化氢,为制备PAGE胶提供自由基。然而,过硫酸铵容易潮解失效,建议小瓶分装,并一次性配成10%的水溶液,分装后冻于-20度保存。 🠓DS-PAGE缓冲体系的选择:对于10-300kDa的蛋白质分离,Tris-Glycine体系是广泛使用的选择。对于小分子蛋白质,Tricine体系更为合适;而对于大分子蛋白质,Tris-Acetate体系则更为有效。 젓DS的作用:SDS是一种阴离子表面活性剂,能与蛋白质分子结合形成短棒状复合物,使蛋白质带上大量负电荷,从而掩盖不同蛋白分子间的天然电荷差异。这样,蛋白样品与SDS充分结合后,主要按照分子量大小进行分离。 发展历程:SDS-PAGE技术自1964年发展以来,已经能够分离2kDa至500kDa的蛋白质,其应用范围不断扩展,成为生物化学和分子生物学研究中的一项重要技术。
SDS-PAGE电泳原理与IEF技术详解 📄S-PAGE电泳原理 SDS-PAGE(十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳)是一种广泛用于分离大分子的技术,包括DNA、RNA和蛋白质。通过施加电场,带电离子在电泳过程中发生迁移。分子的迁移率取决于其净电荷和通过溶液的电阻。SDS(十二烷基硫酸钠)是一种阴离子去污剂,其在较广的pH范围内带有净负电荷。多肽链与SDS结合,其结合量与其相对分子质量成比例,破坏蛋白质的复杂结构。 在SDS-PAGE中,凝胶被分为浓缩胶和分离胶两层。浓缩胶位于底部,较大,而分离胶位于顶部,较窄。电泳缓冲液由甘氨酸制成,pH值为8.3。浓缩胶的pH值为6.8,而分离胶的pH值为8.8。电流由带负电荷的分子携带,向同一个方向迁移。在pH 8.3时,约有10%的甘氨酸分子带负电荷,因此电流主要由堆积缓冲液中的Cl-离子携带。Cl-离子在蛋白质之前朝堆积凝胶底部堆积,使得由SDS包裹的蛋白质分子被夹在甘氨酸分子和Cl-离子之间,被浓缩成比最初加载的体积小得多的条带。随着电流作用迁移,蛋白质迁移到分离胶中。此时,pH为8.8的分离凝胶缓冲液中的甘氨酸成为带负电荷的分子,能够非常快速的迁移,几乎与Cl-离子保持一致,而蛋白质紧随其后。蛋白质经由Cl-和甘氨酸阴离子的移动轨迹进入分离凝胶而携带电流。蛋白质变成一种具有类似流体动力学性质的杆状带负电荷高分子,其迁移率仅取决于其分子质量。 🧭电聚焦IEF分析 等电聚焦(IEF)是一种基于蛋白质等电点(pI)分离蛋白质的电泳技术。当pI=pH时,蛋白质净电荷为0,因此蛋白质不会在电场中迁移。在IEF中,蛋白质的分离是在含有两性电解质混合物的聚丙烯酰胺或琼脂糖凝胶中进行的,两性电解质在电场中迁移并在凝胶中形成pH梯度。蛋白分子被集中在一个具有pH梯度的介质中,通过介质的电流将产生带正电荷的氧化极和带负电荷的还原极。带电的蛋白质分子会向与其有相反电荷的一极运动,直到与周围pH值与其等电点相同时带电分子才停止在凝胶中运动,即蛋白质净电荷为0时。于是,具有相同等电点的蛋白质集中在pH固定的条带中。每种蛋白质都位于pH梯度中与其pI相对应的位置。
免疫共沉淀(Co-IP)实验全攻略 젥 疫共沉淀(Co-IP)简介: 免疫共沉淀是一种利用抗体与抗原之间的特异性免疫反应来研究蛋白质间相互作用的方法。 基本原理: 在细胞裂解液中加入抗原特异性抗体,通过免疫沉淀反应形成免疫复合物。经过纯化、洗脱后,可以通过SDS-PAGE电泳、Western blot或质谱鉴定出与抗原相互作用的蛋白质。 优点: 相互作用的蛋白质都是经翻译后修饰的,处于天然状态。 蛋白的相互作用在自然状态下进行,避免人为影响。 可以分离得到天然状态的相互作用蛋白复合物。 렧 可能检测不到低亲和力和瞬间的蛋白质-蛋白质相互作用。 两种蛋白质的结合可能不是直接结合,可能有第三者起桥梁作用。 必须在实验前预测目的蛋白,选择检测抗体,若预测不正确,实验可能无结果。 : 研究一种已知蛋白质与已知或未知蛋白质间的相互作用。 实验步骤: 用RIPA裂解缓冲液裂解细胞。 用PBS配制50%的Protein A/G-agarose工作液。 加入Protein A/G agarose工作液,4℃摇动10分钟去除非特异性蛋白。 4℃,14000g离心15分钟,去除Protein A/G-agarose微球。 使用BCA法或其他方法测定总蛋白浓度。 加入一抗,4℃过夜。 14000g离心收集沉淀,用预冷洗涤缓冲液洗涤3遍。 收集上清,进行SDS-PAGE、Western blot或质谱分析。 总结: Co-IP是研究蛋白质相互作用的经典方法,虽然存在一些局限性,但通过精心设计和操作,可以获得可靠的实验结果。
自制蛋白上样缓冲液,WB实验更稳定! 自从进入实验室,我发现大部分实验试剂都是自己配置的,尤其是Western blot实验的一整套试剂,从头到尾都是自配的,非常稳定,实用效果非常好!今天就来分享一下如何配置各种蛋白上样缓冲液。 5xNative-PAGE Loading Buffer 訿行天然蛋白的研究分析时,需要使用非变性的蛋白上样缓冲液来处理样品,以保持蛋白的天然活性。相比变性的蛋白上样缓冲液,它不添加去垢剂和还原剂。以下是5xNative-PAGE Loading Buffer的配方(10 mL): 0.25M Tris-HCL (pH 6.8) - 1M Tris-HCL (pH 6.8) 2.5mL 溴酚蓝 (BPB) - 0.5%(WM)0.05g 甘油 - 50%(WM)5mL dH₂O - 2.5mL 配置步骤: 将所有组分混合均匀。 室温或不超过37℃的水浴中溶解非变性蛋白,然后立即放置室温,尽量避免长时间水浴。 各组分的作用 十二烷基硫酸钠 (SDS):破坏蛋白质的二级和三级结构,使其去折叠,覆盖蛋白质本身的电荷,赋予蛋白质净负电荷。同时与硫醇试剂一起使蛋白质线性化,电泳时蛋白质的分离只与分子大小有关。 还原剂:如巯基乙醇或二硫苏糖醇(DTT),用于减少含硫氨基酸(如半胱氨酸)之间产生的二硫键。此外,由于硫醇剂具有抗氧化特性,能够防止半胱氨酸的氧化。与SDS发挥协同作用,使蛋白质线性化。 甘油:增加样品的密度,发挥样品沉降作用。 Tris-HCL:维持pH在6.8左右,防止在低温保存的过程中蛋白质肽键断裂,保证了蛋白质的稳定性;同时,Tris可以抑制酶促反应并防止蛋白酶降解蛋白质。 溴酚蓝:指示样品在凝胶中的位置。 自制蛋白上样缓冲液不仅稳定,而且可以根据实验需求进行调整,确保实验结果的准确性。希望这些配方和步骤对你有所帮助!
泛素化检测秘籍 如何检测蛋白质是否泛素化? 通过免疫共沉淀(CO-IP)方法,可以将特定蛋白质及其结合的蛋白质分离出来。分离后的蛋白质经过SDS电泳和Western blot分析,可以明确哪个蛋白质的哪个赖氨酸残基发生了泛素化修饰。 实验步骤 1️⃣ 细胞接种与转染 接种HEK293细胞,当细胞密度达到40-60%时进行转染。除了目的质粒外,还需转染0.75ug的泛素分子Ub。转染体系包括10ug质粒、20ul转染试剂和400ul高糖完全培养基。 2️⃣ 细胞裂解 用胰酶消化细胞,将其转移到1.5ml离心管中,3500rpm离心5分钟,去除培养基。用PBS清洗细胞,重复两次。 3️⃣ 蛋白提取 向离心管中加入100ul RIPA裂解液和10ul 10%的SDS,混匀后100Ⰳ煮10分钟,以解除被泛素化蛋白与其他蛋白的结合。 4️⃣ 超声破碎细胞 向离心管中加入900ul RIPA裂解液和10ul PMSF,冰上放置30分钟,12000rpm 4Ⰳ离心10分钟。 5️⃣ 蛋白与磁珠结合 取1ml IP Wash Buffer于离心管中,缓慢混匀后加入10ul磁珠,放置于磁力架上3分钟,吸弃IP Wash Buffer,重复清洗磁珠三次。 6️⃣ 免疫共沉淀 取900ul上述所得裂解液于含磁珠的离心管中作为IP组,置于旋转仪上4度旋转过夜。剩余的细胞裂解液作为Input,保存于-20Ⰳ。 7️⃣ 清洗磁珠 第二天将离心管置于磁力架上3分钟,磁珠吸附完毕后吸弃离心管中的溶液。每管加入1ml IP Wash Buffer,旋转仪置于4Ⰳ冰箱中旋转5分钟,吸弃IP Wash Buffer,重复清洗3次。 8️⃣ 煮样 向Input组中加入25ul的5xLoading Buffer,IP组加入80ul用RIPA裂解液稀释的1㗌oading Buffer,振荡混匀后再瞬离,在震荡金属浴中100Ⰳ煮10分钟,震荡频率为1000rpm。
考马斯亮蓝染色:从基础到实践 考马斯亮蓝染色是一种广泛使用的蛋白质染色技术,它利用亮蓝G-250与蛋白质的相互作用,使蛋白质在凝胶中显现出清晰的蓝色条带。 染色类型: 快速染色:通常在1-2小时内完成,但灵敏度较低。 传统染色:需要更长时间(通常一夜),但灵敏度更高。 实验步骤: 1️⃣ 蛋白质电泳:将蛋白质样本通过SDS-PAGE电泳分离,根据蛋白质的大小和电荷选择合适的凝胶和电泳条件。 2️⃣ 染色:电泳结束后,将凝胶放入含有亮蓝G-250染色液的容器中,摇动使染色液均匀接触凝胶。快速染色通常需要摇动1小时,传统染色则需要摇动一夜。 3️⃣ 去染:将染色后的凝胶放入去染液中,摇动使去染液均匀接触凝胶,去除多余的染色液,使背景清晰。快速去染通常需要摇动30分钟至1小时,传统去染则需要摇动2-3小时,或者直到蛋白质条带清晰可见。 4️⃣ 观察和记录结果:将凝胶放在显微镜下观察结果,并使用相机或扫描仪记录结果。 ꠥ訯剂配方: 染色液配方: 亮蓝G-250:0.1%(w/v) 甲醇:50%(v/v) 醋酸:10%(v/v) 去离子水:余量 操作步骤:先将亮蓝G-250溶解在甲醇中,然后加入醋酸,最后加入去离子水,调整到最终体积。 去染液配方: 甲醇:40%(v/v) 醋酸:10%(v/v) 去离子水:余量 操作步骤:先将甲醇和醋酸混合,然后加入去离子水,调整到最终体积。 常见问题和解决措施: 染色效果不好:可能是染色时间不够或染色液配制不正确。解决方法是延长染色时间或检查染色液配制,确保亮蓝G-250的浓度和pH值在正确范围内。 背景太深:可能是去染不充分。解决方法是增加去染时间或更换新鲜的去染液。 观察不到蛋白质条带:可能是蛋白质浓度太低或电泳条件不合适。解决方法是增加样本的蛋白质浓度或优化电泳条件,例如调整电泳电压或时间。
Western Blot试剂配置全攻略 5 mol/L Tris (pH 8.8) (1L) 称取 181.7g Tris 加入约 800ml 去离子水,溶解 用浓盐酸调 pH 至 8.8 加去离子水定容至 1L 4℃保存 1 mol/L Tris (pH 6.8) (1L) 称取 121.1g Tris 加入约 800ml 去离子水,溶解 用浓盐酸调 pH 至 6.8 加去离子水定容至 1L 4℃保存 30% 丙稀酰胺混合溶液 (100ml) 在通风橱中称取丙烯酰胺 29g、双丙烯酰胺 1g 加入 70-80ml 去离子水,溶解 定容至 100ml 0.45 滤膜过滤 4℃避光保存 10% SDS (100ml) 称量 10g SDS(高纯度) 加入约 70-80ml 去离子水,68℃加热溶解 用浓盐酸调 pH 至 7.2 加去离子水定容至 100ml 室温保存 10%(W/V, g/ml)过硫酸铵 (APs) (10ml) 称取 1g 过硫酸铵 加入 10ml 去离子水,溶解 分装后贮存于 -20℃ 使用一周内有效 5㗓DS-PAGE Loading Buffer (10ml) 量取 1M Tris-HCl(pH 6.8)0.6ml 50% 甘油 5ml 10% SDS 溶液 2ml 1% 溴酚兰 1ml 加去离子水定容至 10ml 分装后贮存于 -20℃ 5㗧冲液 (1L) 称取 Tris 粉末 15.1g,甘氨酸 94g,SDS 5.0g 加入约 800ml 去离子水,搅拌溶解 加去离子水定容至 1L 室温保存,使用时稀释5倍 10㗨𐧼冲液 (1L) 称取 Tris 粉末 58.09g,甘氨酸 29.09g,SDS 3.79g 加去离子水定容至 1L 使用时按 1:2:7 的比例分别加入甲醇和去离子水 10㗔BST (1L) 称取 NaCl 80g,Tris-base 24.2g,溶解后调 pH 至 7.6 加去离子水定容至 1L,室温保存
RNA纯化全流程 实验准备: 首先,你需要准备蛋白酶K缓冲液。每个免疫沉淀需要150 ⵌ的缓冲液,具体配方如下:117 ⵌ RIP洗涤缓冲液、15 ⵌ 10% SDS和18 ⵌ 10 mg/mL蛋白酶K。 悬浮免疫沉淀: 将第三节第8步中的每个免疫沉淀重新悬浮在150 ⵌ的蛋白酶K缓冲液中。 解冻input样品: 在试管中加入107 ⵌ RIP洗涤缓冲液、15 ⵌ 10% SDS和18 ⵌ蛋白酶K,使体积达到150 ⵌ。 消化蛋白质: 将所有试管在55Ⰳ下摇晃孵育30分钟,以消化蛋白质。 离心分离: 孵育后,将管短暂离心,并将管放置在磁分离器上。将上清液转移到一个新的试管中。 砦𔗦𖤒NA: 在上清液的试管中加入250 ⵌ RIP洗涤缓冲液。 分离相位: 在每根试管中加入400 ⵌ的苯酚:氯仿:异戊醇。涡旋15秒,在室温下以14000 rpm离心10分钟,以分离相位。 砦取水相: 小心地取出350 水相,将其放入新管中。加入400 ⵌ的氯仿。涡旋15秒,在室温下以14000 rpm离心10分钟,以分离相位。 砥次提取水相: 小心地取出300 的水相,然后放入一个新的试管中。 沉淀RNA: 在每根试管中加入50 ⵌ盐溶液I、15 ⵌ盐溶液II、5 ⵌ沉淀增强剂和850 ⵌ无水乙醇。混合并在-80Ⰳ下保持1小时至过夜,以沉淀RNA。 离心沉淀: 在4Ⰳ下以14000 rpm离心30分钟,小心丢弃上清液。 𘅦𔗦𒉦𗀯用80%的乙醇清洗沉淀一次。在4Ⰳ下以14000 rpm离心15分钟。小心地弃出上清液,晾干沉淀。重新悬浮在10到20 ⵌ的无RNase的水中,并将管子放在冰上。
ꠓDS-PAGE电泳操作指南 配制SDS-PAGE凝胶时,务必关注以下几点: 1️⃣ 试剂有效期与清澈度:定期检查配胶试剂,一旦发现沉淀或结晶,请立即更换。 2️⃣ pH选择与浓度:根据实验需求,谨慎选择pH8.8或pH6.8的Tris-HCl,并注意1.0M与1.5M的浓度差异。 3️⃣ 储存与保护:4℃下保存的10%SDS易结晶,需小心使用。30%丙烯酰胺应避光且4℃以下保存。APS建议分装后冷冻保存于-20℃。 4️⃣ 通风与安全:TEMED具有刺激性气味和挥发性,使用时请确保通风良好,并避免直接暴露。 5️⃣ 插梳子技巧:斜插梳子可有效避免气泡产生,确保电泳质量。 6️⃣ 胶条保养:电泳结束后,将胶条置于实验台上自然晾干。若胶条老化或出现裂纹,可加保鲜膜保护,延缓老化并防止胶液泄漏。 7️⃣ 保存与使用:胶液最好现配现用。若需保存,请用湿润的保鲜膜包好,并置于4℃冰箱中。 遵循这些步骤,你的SDS-PAGE电泳实验将更加精准、高效!ꀀ
WB缓冲液配方大全,实验必备! 上样缓冲液 SDS 上样缓冲液(Laemmli 缓冲液):63 mM Tris-HCl、10% 甘油、2% SDS、0.0025% 溴酚蓝,pH 6.8 2X 储存液配方 LDS上样缓冲液:106 mM Tris-HCl、141 mM Tris base、2% LDS、10% 甘油、0.51 mM EDTA、0.22 mM SERVA Blue G250、0.175 mM 酚红,pH 8.5 4X 储存液配方 电泳缓冲液 Tris- 甘氨酸 SDS 电泳缓冲液:25 mM Tris base、192 mM 甘氨酸、0.1% SDS,pH 8.3 Tris- 甘氨酸非变性电泳缓冲液:25 mM Tris base、192 mM 甘氨酸,pH 8.3 MOPS SDS 电泳缓冲液:50 mM MOPS、50 mM Tris base、0.1% SDS、1 mM EDTA,pH 7.7 MES SDS 电泳缓冲液:50 mM MES、50 mM Tris base、0.1% SDS、1 mM EDTA,pH 7.3 Tricine SDS 电泳缓冲液:100 mM Tris base、100 mM tricine、0.1% SDS,pH 8.3 转印缓冲液 Tris-甘氨酸转印缓冲液:12 mM Tris base、96 mM 甘氨酸, pH 8.3 Bis-Tris 转印缓冲液:25 mM bicine、25 mM Bis-Tris(游 离碱)、1 mM EDTA,pH 7.2 这些配方是进行WB实验时常用的缓冲液配方,根据实验需求选择合适的缓冲液,以确保实验结果的准确性。
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