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关键词突变图谱在线播放_有丝分裂各个阶段图(2024年12月免费观看)

内容来源：天哥SEO所属栏目：导读更新日期：2024-12-02

关键词突变图谱

Citespace到底过时了吗？𐟤” 𐟓š Citespace是什么？ Citespace是一款非常强大的文献可视化分析软件。它的主要功能是在海量文献数据中帮你找到关键信息，让你能从全局视角把握研究热点、前沿和未来发展趋势。 𐟌Ÿ Citespace的亮点虽然Citespace可能没有一些工具那么“智能”，但它依然有很多用户。对于那些不擅长编程、不熟悉各种复杂工具的人来说，Citespace仍然是一个快速了解领域发展情况、辅助研究综述撰写、绘制精美图表的好选择。 𐟓ˆ Citespace的功能知识图谱绘制：Citespace可以将文献间的关系以可视化图谱的形式呈现，让你更加直观地理解研究领域的知识结构和发展趋势。主题演化分析：通过Citespace的主题演化分析功能，你可以了解研究主题的演变过程，以及各阶段的研究热点和重点。合作网络分析：Citespace可以展示作者、机构和国家的合作情况，帮助你发现潜在的合作关系和合作模式。共被引分析：通过共被引分析，你可以找到领域内的重要文献和关键知识点，深入理解研究领域的前沿和发展方向。突变词检测：Citespace可以检测到文献中出现频率突然增加的关键词，帮助你发现新的研究热点和趋势。聚类分析：Citespace的聚类分析功能可以将相似的文献聚类到一起，让你更加方便地了解各领域的研究现状和主要研究成果。 𐟒ᠦ€𛧻“ 虽然有些工具可能更智能，但Citespace在文献可视化分析方面依然有其独特的优势。对于很多研究者来说，它仍然是一个非常实用的工具。

Citespace使用：从零到图谱 𐟓š 准备工作在开始使用Citespace之前，首先需要安装Java 17，并确保Java版本与Citespace版本兼容。安装好Java后，就可以下载Citespace了。 𐟓‚ 数据转化创建文件夹：首先，为你要研究的论文创建一个文件夹，命名为CNKI。然后在CNKI文件夹中创建四个子文件夹：data、input、output和project。下载数据：登录知网，根据主题或关键词进行高级检索，批量导出Refworks格式的文件，并将这些文件保存到input文件夹中，文件名需以download_开头。注意，知网一次最多支持500篇文献的下载，如果需要的文献超过500篇，可以分批次下载。转化数据：打开Citespace，点击Data—Input/Export—CNKI，选择input和output文件夹中的对应文件夹，然后点击转化。复制文件：将转化后的文件复制到data文件夹中。创建项目：回到Citespace软件界面，找到project窗口，点击new建立项目。选择CNKI文件夹中的project文件夹作为项目home，选择data文件夹作为数据目录，然后点击CNKI/WanFang并保存。设置时间切片：根据需要选择合适的时间切片。选择节点类型：在Node Types中取消Reference选项（知网三个红色的选项是选不了的），选择需要可视化的节点类型（如author、institution、keywords等），然后点击绿色的GO按钮。 𐟎蠥﨧†化操作运行结束后选择visualize。关键词图谱、作者图谱、机构图谱：在Control Panel—labels中选择关键词或作者标签，调节阈值和字体大小。关键词聚类时间图谱：选择K—LLR—timeline或者直接点timeline（这软件bug多）。如果聚类太多，可以减少聚类数量，选择最大的K个聚类。突变词图谱：在Control Panel中找到Burstness—Refresh（如果突变词不够再往下操作）—0，1]设置更小些—Refresh。 𐟖Œ️ 美化图谱取消标签底色：在Labels—term labels中选择HSV(H)。拖动节点调节：可以直接拖动节点进行调节（如果不能拖动将笔记本电脑缩放成100%再重启电脑）。

质粒那些事儿，必看小技巧！拿到质粒后，首先要确保你拿到的是全序列。最保险的做法是自己测序，至少要把核心区域测了。比如说，一个一万五六千bp的质粒，测个七八千bp的核心区域，也就几百块钱。这样能确保质粒没问题，后面再用也不怕浪费时间和推倒重来。有个网友做木本植物的基因编辑，稳定转化后拿到了100多个抗性芽，但检测不到靶基因编辑。我第一反应就是质粒有问题。建议他去测个序，结果发现cas9上有单核苷酸突变，很可能导致cas9功能丧失，核酸切割能力下降，最后检测不到基因编辑事件。还有一个例子是，有个年轻老师在国外做博士后时，实验室集中力量给一个中国博士做课题，想堆大文章。做到后期发现实验结果和假说反着来，总有些地方说不通。最后确定是质粒出了问题，测序发现质粒有突变。结果前面所有跟质粒相关的实验都得推倒重来，项目进度被大大拖延。那个老师当时又要回国，签证都快到期了，真是惨不忍睹。有些质粒的部分区域没有标出来，可以去NCBI上Blast，总会找到蛛丝马迹，甚至有的会很明确地标出来具体是什么东西。我最喜欢的画质粒图谱的软件是SnapGene，这个软件的厉害之处用过的人都知道，真的非常方便。在动手做质粒相关的实验前，一定要学会如何阅读图谱。看关键区域，每一个元件的作用都要轻车熟路才能去做下一步实验。质粒上的酶切位点，尤其是常用的，都要标出来。有的酶切位点是单个切点，有的有两个甚至多个。哪怕是构建载体这种小实验，也要事先把每一步在理论上都演练一遍，弄得清清楚楚，这样成功的概率才会高，才会真的节省时间。构建载体时建议把方案给有经验的人看看，有时候人是当局者迷，旁观者清。没发现问题最好，发现了问题也可以庆幸自己多留了个心眼。

系统级解析EMT与免疫逃逸在癌症中的关系 𐟔 探索上皮间充质转化（EMT）与免疫逃逸在癌症中的相互作用，这篇文章于2021年6月发表在npj precision oncology上，杂志的影响因子为8.254。文章旨在从系统级角度分析EMT和免疫反应对多种癌症类型的影响。 𐟌𑠨ƒŒ景介绍 EMT是细胞从上皮形态转变为间充质形态的过程，与多种恶性肿瘤相关，并影响癌症的进展和预后。研究表明，EMT在治疗期间和治疗后的出现常常与治疗耐药和癌症复发有关。最近，有证据表明EMT与免疫反应同时存在，但目前缺乏对两者相互作用的全面了解。 𐟓š 材料与方法数据获取文章从癌症基因组图谱TCGA中获取了多组学数据，包括17种不同类型实体癌的8200个肿瘤的表达谱、外显子测序数据和临床数据。此外，还收集了五个接受免疫阻断疗法（ICB）的独立免疫疗法数据集。文章还从Charoentong等人的研究中获取了28种免疫细胞类型的327个转录组数据，并从CCLE数据库下载了癌细胞的转录组数据。从TCGA获得了非同义突变数据和基因组不稳定性数据，以及之前研究中获得的泛癌中的拷贝数变异（CNV）和驱动基因数据。 𐟔젥ꌨ通过综合分析这些数据，文章旨在揭示EMT和免疫逃逸在多种癌症类型中的相互作用，以及它们对肿瘤行为和临床结果的影响。这将有助于更好地理解癌症的复杂生物学机制，并为未来的治疗策略提供新的视角。

2024年生信分析必备：十大数据库详解大家好！今天为大家带来一份超实用的生物信息学资源清单，适合所有生物信息学的小伙伴们。以下是2024年必知的十大数据库，赶紧收藏吧！ 𐟌Ÿ【NCBI GEO】𐟓Š：单细胞数据的宝库，疾病研究的好帮手。 𐟔【PubMed】𐟓š：文献检索的全能王，生信分析的起点。 𐟧죀NHANES】𐟓ˆ：流行病学研究的火种，孟德尔随机的摇篮。 𐟔죀Biobank】𐟧쯼šGWAS数据的金矿，遗传学奥秘的挖掘者。 𐟓ˆ【TCGA】𐟓Š：多组学数据的宝库，样本齐全的科研天堂。 𐟗𚯸【GEPIA】𐟗𚯸：差异分析和预后分析的神器，TCGA数据的好帮手。 𐟧죀Cbioportal】𐟧쯼š突变数据的全景图，预后分析的好帮手。 𐟖𜯸【UALCAN】𐟖𜯸：深入研究RNA-seq，预测药物靶点的利器。 𐟎裀TCIA】𐟎诼š影像组学与病理组学的结合，多模态研究的未来。 𐟌【The Human Protein Atlas】𐟌：免疫组化图谱，疾病研究的新视角。这些数据库不仅能为你的研究提供丰富的数据资源，还能帮助你在生信分析的道路上少走弯路，快速达到科研的高峰。赶紧收藏这份清单，让你的生信分析事半功倍！

2024年Nature类器官研究精选合集 𐟎“ 探索2024年Nature期刊中类器官领域的最新研究，这里汇集了11篇精选文章，涵盖了人类神经类器官、肠道再生、免疫调节、组织发育及癌症等多个领域。 1️⃣ 神经类器官的转录组细胞图谱：揭示了人类神经类器官的细胞组成和发育过程，为理解神经系统发育提供了新的视角。 2️⃣ 肝脏X受体的新发现：研究发现肝脏X受体在肠道再生与肿瘤发生之间起到解耦作用，强调了其在肠道健康中的重要性。 3️⃣ 胎儿皮肤图谱的免疫学秘密：建立了一个胎儿皮肤图谱，揭示了免疫系统在调节人类皮肤形态发生中的作用。 4️⃣ 肠道中的再生干细胞：发现毛状细胞在人体肠道中充当再生干细胞，参与肠道的修复和再生过程。 5️⃣ 乳腺组织中的场癌变机制：探讨了清除突变的机制如何推动乳腺组织中的场癌变现象，为乳腺癌研究提供了新思路。 6️⃣ 禁食后的肠道干细胞增强：研究表明短期禁食后的再进食通过多胺增强肠道干细胞的特性，为肠道健康研究提供了新方向。 7️⃣ 自体免疫类器官模型：开发了具有自体组织常驻免疫成分的人类类器官，为研究免疫反应提供了新模型。 8️⃣ 脑类器官模型揭示个体易感性：脑类器官模型揭示了个体对神经毒性刺激的易感性，提供了对神经系统疾病的理解。 𐟔 这些研究不仅推动了类器官领域的进展，也为相关疾病的研究和治疗提供了新的可能。

苯丙酮尿症：了解这一罕见遗传病的全面指南苯丙酮尿症（PKU）是一种常染色体隐性遗传疾病，由于苯丙氨酸羟化酶基因突变，导致酶活性降低或丧失，使苯丙氨酸不能正常代谢，进而在体内积累，生成苯丙酮酸及其衍生物。这些代谢产物的异常积累会导致一系列严重的健康问题。𐟔 1.𐟧 神经系统智力发育落后：这是苯丙酮尿症最为突出的症状。患儿出生时可能表现正常，但通常在3-6个月开始出现智力发育迟缓，1岁时症状明显。他们可能表现出行为异常，如兴奋不安、忧郁、多动、孤僻等。 2.𐟒†皮肤改变：由于黑色素合成不足，患儿的头发由黑变黄，皮肤变得白皙。此外，皮肤还可能出现红斑、丘疹等症状，伴随结痂、脱屑，且常有瘙痒感。 3.𐟒椽“味改变：由于尿液和汗液中排出较多的苯乙酸，患儿可能散发出明显的鼠尿臭味。 𐟔즣€查与诊断𐟔슊1.𐟑𖦖𐧔Ÿ儿筛查：新生儿出生后72小时，通过采集足跟血进行Guthrie细菌生长抑制试验，可以初步筛查出苯丙酮尿症。 2.𐟧ꈐLC尿喋呤图谱分析：通过测定尿中新蝶呤和生物蝶呤的含量，有助于鉴别诊断不同类型的苯丙酮尿症。 3.𐟧 氢质子磁共振波谱检测：利用磁共振技术检测患儿脑内苯丙氨酸的浓度，为治疗提供重要依据。 4.𐟧쥟𚥛 检测：有助于苯丙酮尿症的基因诊断及产前诊断，帮助家庭预防疾病的发生。 𐟒Š治疗方法𐟒Š 1.𐟍𝯸饮食治疗：患者需限制摄入含苯丙氨酸的食物，同时增加富含其他必需氨基酸的食物。低苯丙氨酸配方奶是治疗初期的重要选择，随着血苯丙氨酸浓度降低，可逐渐添加低蛋白、低苯丙氨酸的天然饮食。 2.𐟒Š药物治疗：对于难以控制的症状，如抽搐等，可以遵医嘱使用别嘌醇片、盐酸沙利匹汀片等药物进行治疗。 3.𐟏娂移植：对于极少数病情严重的患者，可能需要进行肝移植手术，以恢复正常的代谢功能。 𐟒ᦗ奸𘥰贴士𐟒ኊ1.𐟥橥Ÿ管理：患儿应多食用低苯丙氨酸的食物，如猪油、牛油、奶油、植物油、芝麻酱、蜂蜜、蔗糖等。同时，保证足够的脂肪和碳水化合物摄入，以满足机体热量的需要。 2.𐟌🥤š吃新鲜蔬菜和水果：如茄子、葱头、柿子、白菜等，以补充维生素。 3.𐟧˜‍♀️定期监测与复查：患儿应定期接受医疗检查，监测血苯丙氨酸浓度和神经系统发育情况，及时调整治疗方案。 4.𐟒꥿ƒ理支持：由于苯丙酮尿症可能导致智力发育落后和行为异常，家长应给予患儿足够的关爱和支持，帮助他们建立自信，积极面对生活。通过这篇文章，希望您能更加全面地了解苯丙酮尿症这一罕见遗传病，为患儿及其家庭提供有效的帮助和支持。𐟒–

rt是什么意思 𐟔점CR（聚合酶链式反应）：PCR的目的是扩增特定的DNA序列。它利用DNA聚合酶在特定温度下复制DNA片段。PCR的应用非常广泛，包括基因克隆、DNA指纹图谱和病原体检测等。 𐟔젱PCR（定量PCR）：qPCR的目的是定量分析DNA拷贝数。它在PCR的基础上加入荧光探针或染料，实时监测每个循环中扩增的DNA量。qPCR的技术包括使用SYBR Green染料或TaqMan探针等，主要应用于基因表达分析、病原体定量和遗传突变检测。 𐟔젒T-PCR（逆转录PCR）：RT-PCR的目的是从RNA模板扩增cDNA。它首先使用逆转录酶将RNA转录为cDNA，然后利用DNA聚合酶进行PCR扩增。RT-PCR的应用包括检测特定mRNA的表达和基因表达分析等。 𐟔젒T-qPCR（逆转录定量PCR）：RT-qPCR的目的是定量分析RNA序列的表达水平。它结合了RT-PCR和qPCR的技术，先逆转录为cDNA，然后进行实时定量PCR。RT-qPCR的技术包括使用SYBR Green染料或TaqMan探针等，实时监测cDNA的扩增。其主要应用于miRNA表达分析和病原体RNA定量等。 𐟓Š PCR和qPCR通常用于DNA的分析，而RT-PCR和RT-qPCR则用于RNA的分析。不同PCR方法的主要优缺点如图三所示。

单细胞图谱：从1870年至今的惊人变化想象一下，回到1870年，当Santiago Ramon y Cajal首次手绘出神经细胞图谱时，当时的人们可能会觉得这不过是无稽之谈。毕竟，谁能想到神经元竟然是单个存在的呢？时间跳转到今天，Sten Linnarsson利用单细胞测序技术绘制出了首张大脑发育图谱，这简直让人叹为观止，仿佛是一件精妙绝伦的艺术品。这才是生物信息学研究应该达到的高度。说到单细胞图谱，首张图谱无疑是最为精美的。它就像一张航海图，周围的小岛代表着四个不同维度的属性。从中我们可以学到很多：在单个小图里，作者巧妙地将多个维度的信息整合在一起，这样大量冗余的空白信息就被省略了，整体显得简约而不失高雅。相比之下，我自己绘制的图谱（图4）每个标记基因各占一个小图，虽然表意明确，但稍显拖沓。第二张图谱的精妙之处在于它提出了一种展示标记基因的新方式——Beeswarm蜂巢图。在小提琴图盛行的当下，这种图形设计宛如一股清流，风格突变，令人眼前一亮。甚至连图中的箭头都设计得极为自然流畅，真可谓独具匠心。第三张图谱也是精妙非凡。随着发育时间的推移，细胞的排列呈现出如此规整有序的态势（图e），乍一看，其规整程度甚至让人怀疑其真实性。在这张图谱中，作者创新性地将两个基因的表达值合并，以此清晰展现与之对应的细胞类型。这种方法在处理一些异质性较高但又同属一类的情况时，会极为有效，例如在标记异质性极高的癌细胞时便可大显身手。反观我自己绘制的图谱，当时创作完成之际，自我感觉尚佳，然而如今再审视，却越瞧越觉其貌不扬。色彩搭配相形见绌，标签设置太过刻板守旧，细胞缺乏平滑过渡效果等等，诸般不足之处尽显无遗。这些图谱不仅展示了单细胞测序技术的巨大潜力，也让我们对大脑的复杂性和美丽有了更深的认识。每一幅图都是对科学探索的致敬，也是对未来发展的美好憧憬。

rt是什么意思 𐟧점CR（聚合酶链式反应）：目的是扩增特定的DNA片段。通过DNA聚合酶在特定温度下循环（通常是95℃变性、55℃退火、72℃延伸）来复制目标DNA片段。应用场景包括基因克隆、DNA指纹图谱、病原体检测等。 𐟓Š RT-qPCR（逆转录定量聚合酶链式反应）：目的是定量分析某个mRNA的表达水平。首先使用逆转录酶将RNA转录为cDNA，然后利用实时定量PCR技术进行扩增。通过加入荧光标记探针或染料，实时监测每个循环中扩增的DNA量。最终通过分析数据计算目的基因的表达量。 𐟔„ RT-PCR（逆转录聚合酶链式反应）：目的是从RNA模板扩增cDNA。首先使用逆转录酶将RNA转录为cDNA，然后利用DNA聚合酶进行PCR扩增。应用场景包括检测特定mRNA的表达、基因表达分析等。 𐟔 qPCR（定量聚合酶链式反应）：目的是定量分析DNA序列的拷贝数。在PCR基础上加入荧光标记探针或染料，实时监测每个循环中扩增的DNA量。技术包括使用SYBRGreen染料或TaqMan探针等。应用场景包括基因表达分析、病原体定量、遗传突变检测等。通过这些技术的结合，可以实现对特定基因表达水平的精确测量和分析。

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